1. Polytetrafluoretylenová membrána je vyrobena z PTFE, který je zcela přirozeně hydrofobní. I při velmi nízkém tlakovém rozdílu může zajistit nerušený průchod vlhkého vzduchu nebo jiných plynů, zatímco vodný roztok nemůže projít. Jeho výkon je přesně opačný než u hydrofilní membrány. PTFE filtrační membrána má silnou chemickou kompatibilitu a je vhodná pro filtraci téměř všech organických rozpouštědel a silně korozivních chemikálií. Když musí být vodný roztok filtrován PTFE filtrační membránou, vodný roztok může být filtrován pouze po předběžné infiltraci ethanolem nebo isopropanolem.
2. Předfiltrační membrána ze skleněných vláken (GF): používá se ke zlepšení rychlosti filtrace a kontinuální filtrace; Filtrační membrána ze skelných vláken patří k hloubkové filtraci, která se používá hlavně jako předfiltrační vrstva a přidává se přímo na filtrační membránu.
3. Nylonová filtrační membrána (polyamid, nylon): používá se pro filtraci alkalických roztoků a organických rozpouštědel;
Nylonová membrána má velmi dobrou mechanickou pevnost a silnou adsorpci. Snese většinu organických rozpouštědel a většinu alkalických roztoků. Je vhodný zejména pro filtraci alkalických roztoků. Pro filtraci organickým rozpouštědlem, jako je filtrace částic pomocí HPLC mobilní fáze, je nylonová membrána ekonomičtější a praktičtější než membrána PTFE. Kromě toho lze jako přenosovou membránu použít také nylonovou membránu. Vzhledem k relativně vysokému adsorpčnímu výkonu nylonové membrány se obecně nedoporučuje používat pro filtraci kultivačního média nebo biologických vzorků, jako je proteinový roztok, aby se zabránilo ztrátě vzorků v důsledku adsorpce. V tomto případě se obvykle používá membrána z acetátu celulózy (CA) s nízkou adsorpcí, která je vhodnější.